Hola Roberto,
Te digo lo mismo que Blanca, lo primero lo siento por la tardanza en responder, y segundo que no es tan malo como puedas oir, aunque algo de verdad hay.
Conozco a muchos extranjeros que han tenido bebes en Jakarta sin ningun problema (Blanca, por ejemplo), pero si llegas aqui sin conocer nada puede ser complicado. Siempre es mejor ir a un medico que alguien te recomiende a ir a uno que no conoces.
Respecto a la contaminacion, es todo cierto y mas :-)
Respecto al tema profesional, como te ha dicho "tonyxc", esto esta creciendo una barbaridad, con lo que hay muchas oportunidades, asi que es algo que te puedes plantear, si te interesa por el lado profesional o personal.
Mi opinion es que no es tanto el riesgo, como te puedan haber hecho pensar. Conozco a muchos expatriados que a pesar de todo esto, viven bastante felices aqui.
Un saludo.